Morten Larsen er ph.d. i middelalder- og renæssancearkæologi og har en solid baggrund inden for arkæologi, forskning og ledelse. Siden 1. april 2025 har han været leder af den arkæologiske afdeling ved Museum Sønderjylland, hvor han efterfølger Lennart S. Madsen.

Han kommer fra en stilling som museumsinspektør og kirkekonsulent ved Nationalmuseet, hvor han arbejdede i 3,5 år, og har tidligere været leder af den arkæologiske afdeling ved Vendsyssel Historiske Museum, herunder et halvt år som konstitueret museumsdirektør.

Morten Larsen har bred erfaring som gravende arkæolog og formidler, blandt andet fra Moesgaard Museum, og skal i årene frem mod 2028 stå i spidsen for en revitalisering af Museum Sønderjyllands arkæologiske afdeling med nye udstillinger og styrket formidling af regionens kulturarv ved den dansk-tyske grænse.